通用气相色谱仪的载气系统主要作用是为保证进样系统、色谱柱系统和检测器的正常工作提供稳定的载气和有关检测器必需的燃气、助燃气以及有关辅助气。气路控制系统的好坏将直接影响分离效率、稳定性和灵敏度，从而将直接影响定性定量的准确性。气路控制系统包括气源系统，净化系统，压力流量控制系统，仪器气路。主要由开关阀、稳压阀、针形阀、切换阀、压力表、流量计等部件组成。
作为气相色谱载气的气体，要求要化学稳定性好、纯度高、价格便宜并易取得，能适合于所用的检测器。常用的载气有氢气、氮气、氩气、氦气、二氧化碳气等等。其中氢气和氮气价格便宜，性质良好，是用作载气的良好气体。
对于气源来说，选择高压气瓶还是气体发生器，要看具体情况而定。钢瓶一般更换方便，且气体质量可以保证，成本相对不高，但有可能会延误试验时间。气体发生器使用时间没限制，目前市场上有各种空气压缩机，氢气发生器和氮气发生器，但纯度问题不容忽视，且空气压缩机是以实验室空气为气体来源的，可能有油污，有机杂质含量可能会高一些，净化装置就要经常更换。一般使用钢瓶时3个月需更换一次过滤器填料，用气体发生器则每月更换一次。使用气体发生器的好处是方便省事，不用频繁更换钢瓶。但是一次性投资要大些。
另一方面，从安全角度看，氢气钢瓶必须放置到实验室以外的安全地方，有可能给工作带来不便，因此使用氢气发生器好一些。
